دانلود مقاله جستجو و خوشه بندی گروه های بزرگ، سریع تر از بلاست
تعداد کلمات فایل انگلیسی:1300 کلمه 2 صفحه pdf
تعداد صفحات فایل ترجمه:3 صفحه word فونت 11 B Nazanin
جستجو و خوشه بندی گروه های بزرگ، سریع تر از بلاست
چکیده
انگیختگی
داده های توالی بیولوژیکی به سرعت در حال جمع شدن هستند که توسعه و پیشرفت روش های توان عملیاتی خوب را برای طبقه بندی توالی، تحریک می کنند.
نتایج
یو بلاست و یو سرچ، الگوریتم های جدیدی هستند که امکان جستجوی محلی و جهانی از پایگاه داده های توالی با سرعت فوق العاده بالارا می دهند. آنها در برنامه های کاربردی عمدتا سریع تر از بلاست عمل می کنند، گرچه حساسیت روابط پروتئینی ناهمگون پایین تر است. یو کلاست، یک روش خوشه بندی جدید است که یو سرچ را بمنظور تخصیص توالی به خوشه، استخراج می کند. یو کلاست مزایای متعددی نسبت به برنامه سی دی-هیت، شامل سرعت بالاتر، استفاده کمتر از حافظه، حساسیت بهبود یافته، خوشه بندی در هویت های پایین تر و طبقه بندی مجموعه های بسیار بزرگتر، دارد
Search and clustering orders of magnitude faster than BLAST
ABSTRACT
Motivation: Biological sequence data is accumulating rapidly,motivating the development of improved high-throughput methods for sequence classification.
Results: UBLAST and USEARCH are new algorithms enabling sensitive local and global search of large sequence databases at exceptionally high speeds. They are often orders of magnitude faster than BLAST in practical applications, though sensitivity to distant protein relationships is lower. UCLUST is a new clustering method that exploits USEARCH to assign sequences to clusters. UCLUST offers several advantages over the widely used program CD-HIT,including higher speed, lower memory use, improved sensitivity,clustering at lower identities and classification of much larger datasets
کد:4-10781
دانلود رایگان مقاله انگلیسی:
رمز فایل:www.downloadmaghaleh.com
دانلود مقاله دات کام 
توضیحات محصول
دانلود مقاله جستجو و خوشه بندی گروه های بزرگ، سریع تر از بلاست
تعداد کلمات فایل انگلیسی:1300 کلمه 2 صفحه pdf
تعداد صفحات فایل ترجمه:3 صفحه word فونت 11 B Nazanin
جستجو و خوشه بندی گروه های بزرگ، سریع تر از بلاست
چکیده
انگیختگی
داده های توالی بیولوژیکی به سرعت در حال جمع شدن هستند که توسعه و پیشرفت روش های توان عملیاتی خوب را برای طبقه بندی توالی، تحریک می کنند.
نتایج
یو بلاست و یو سرچ، الگوریتم های جدیدی هستند که امکان جستجوی محلی و جهانی از پایگاه داده های توالی با سرعت فوق العاده بالارا می دهند. آنها در برنامه های کاربردی عمدتا سریع تر از بلاست عمل می کنند، گرچه حساسیت روابط پروتئینی ناهمگون پایین تر است. یو کلاست، یک روش خوشه بندی جدید است که یو سرچ را بمنظور تخصیص توالی به خوشه، استخراج می کند. یو کلاست مزایای متعددی نسبت به برنامه سی دی-هیت، شامل سرعت بالاتر، استفاده کمتر از حافظه، حساسیت بهبود یافته، خوشه بندی در هویت های پایین تر و طبقه بندی مجموعه های بسیار بزرگتر، دارد
Search and clustering orders of magnitude faster than BLAST
ABSTRACT
Motivation: Biological sequence data is accumulating rapidly,motivating the development of improved high-throughput methods for sequence classification.
Results: UBLAST and USEARCH are new algorithms enabling sensitive local and global search of large sequence databases at exceptionally high speeds. They are often orders of magnitude faster than BLAST in practical applications, though sensitivity to distant protein relationships is lower. UCLUST is a new clustering method that exploits USEARCH to assign sequences to clusters. UCLUST offers several advantages over the widely used program CD-HIT,including higher speed, lower memory use, improved sensitivity,clustering at lower identities and classification of much larger datasets
کد:4-10781
دانلود رایگان مقاله انگلیسی:
رمز فایل:www.downloadmaghaleh.com